京基智农拥有华南农业大学京基智农技术研究院、畜禽养殖污染控制与资源化技术国家工程实验室实验示范基地、黄鸡育种中心与养殖技术试验基地、华南地区发酵床养禽技术研发基地、广东省安全环保高效型饲料工程技术研究中心、华南师范大学水产优质环保养殖产学研基地、东莞市院士工作站等。

2021年，技术研究院在猪场粪污处理、种猪繁育、能繁种猪专用代谢中间产物营养包研制及应用、生猪养殖减抗增效产品研发、非瘟防控等5大合作项目课题的研究上取得一定成果。

2021年2月2日，公司与中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所建立合作关系，围绕种业领域的核心需求和关键技术开展长期持续攻关，为打赢种源“翻身仗”提供科技支撑，为保障国家粮食安全贡献深圳方案。

公司长期与中国科学院亚热带农业生态研究所畜禽健康养殖中心、广东省农科院、珠江水产研究所、华南农业大学、华南师范大学、华中农业大学等建立产学研合作关系，现已获国家发明及实用新型专利数十项。

其中“康达尔黄鸡128配套系”是全国首个通过农业部国家级审定的黄鸡配套系，其培育的“康达尔黄鸡”被列入国家家禽基因库；“康达尔黄鸡父母代种鸡标准”（标准号：DB440300/T1-1998）成为深圳首个农业地方标准；多项产品也被认定为“广东省名牌产品”“广东省高新技术产品”等。2018年，“华南地区发酵床养禽关键技术研究与示范”顺利通过验收，荣获“广东省科技成果”证书。